Авторизация / Регистрация

[Programma_Boinc]

Обновлениеперезапуска Africa Rainfall Project (ARP)

Команда ARP готовится к перезапуску после того, как проектбыл приостановлен в декабре 2022 года. В этой статье описаны шаги, которые мыпредпринимаем для перезапуска этого проекта.


Проект: дождевыеосадки в Африке
Опубликовано: 25 апреля 2024 г.
Фон


Проект Africa Rainfall Project (ARP) направлен намоделирование ливней в странах Африки к югу от Сахары для улучшениярегиональных прогнозов погоды. Цель состоит в том, чтобы запуститьмоделирование погоды с высоким разрешением (1 км) для всего региона в течениеодного года.


Предоставление точных прогнозов погоды имеет решающеезначение для самообеспеченности местного фермерского сообщества. Сравниваярезультаты, полученные в результате расчета данных об осадках из различныхисточников с использованием World Community Grid, ученые могут создавать всеболее точные прогнозы, улучшать будущие симуляции и, в свою очередь,прогнозировать погоду.


Дополнительную информацию об этом проекте можно найти внашем обновлении исследования за март 2022 года.
https://www.worldcommunitygrid.org/a...?articleId=766


В декабре 2022 года проект был поставлен на паузу из-заограничений емкости системы хранения. Чтобы узнать больше о деталях этогоограничения хранилища, обратитесь к обновлению ARP от марта 2023 года.
https://www.worldcommunitygrid.org/a...?articleId=781


Как мы сообщали в обновлении от июля 2023 года, частью этойпроблемы было то, что поддержка хранилища командой ARP со стороны SURF,совместной ассоциации голландских образовательных и научно-исследовательскихучреждений прекратили свое существование.


К счастью, Amazon Web Services (AWS) согласилась разместитьданные, и таким образом начался процесс их перемещения. После завершенияпереезда команда ARP предпринимает шаги, чтобы сделать данные более доступнымичерез платформу AWS, но эта работа все еще находится на ранних стадиях. Внастоящее время основное внимание уделяется завершению подготовки новых рабочихблоков и созданию данных, необходимых для перезапуска ARP.


Обновлениеперезапуска ARP

Мы начали работу над возобновлением рассылки волонтерамрабочих модулей ARP1. Наши партнеры по исследованиям из Делфтского техническогоуниверситета уже прислали нам большую часть необходимых сценариев идокументации, которые мы рассмотрели и внедрили на месте.


В настоящее время мы ожидаем решения о том, получим ли мыостальные необходимые данные и код приложения напрямую или нам нужно будетвоспроизвести эти компоненты из документации, предоставленной командой TUDelft. Мы оценили, что оба подхода осуществимы, и хотели сообщить волонтерам,что мы находимся на определенном пути к перезапуску ARP1 в ближайшие недели.


Сроки возможного перезапуска этого проекта зависят отинформации от команды ARP.


Если требуемый код и данные не полностью доступны нам, намнужно будет создать недостающие компоненты конвейера для создания новой работыARP1 и подтвердить, что мы можем воспроизвести те же входные данные, которые мыранее получали от серверов TU Delft.


В любом случае, никаких изменений и действий со стороныдобровольцев для облегчения процесса не потребуется, и когда ARP1перезапустится, распределение рабочих единиц будет таким же, как и раньше.


Рисунок 1. Пример агрегата. Каждый блок состоит из трехвложенных доменов (однонаправленных) с разрешением соответственно 9 км, 3 км и1 км.
https://www.worldcommunitygrid.org/f...ffset,0#696179


Спасибо команде ARP за постоянное сотрудничество с WCG. Еслиу вас есть какие-либо вопросы или комментарии, пожалуйста, оставьте их в этойтеме, чтобы мы могли ответить.
Хотите принять участие в распределенных вычислениях, тогда,Вам сюда:
https://boinc.ru

[ухожу]

Обновлениеперезапуска каойтоботмайнер опятьвернулся

Рисунок 1. Пример причиндала. йух.жпг фон

у них там целый форум с набросами чатгпт. все друг друга хвалят и восхищаются какое дно

[Programma_Boinc]

Вот, достался по случаю, такой вот Intel Optane Memory на 16 гигабайт за 500р., а до этого он лет пять работал в каком то маломощном сервере. Лежал он,лежал у меня уже давно и чета недавно решил я перебрать комп. Но, так как наматеринской плате нет этого разъёма, пришлось идти за переходником в днс, за700 руб. (кошмар цены)
А вот что показывает программа Hard Disk Sentinel 5.40.1 и его фото вкомпьютере.
В общем установил я этот Intel Optane в пк, через разъем PCI Express x1.Установил туда Boinc.
А сделал я это, что бы не портить ресурс системного ssd. И кто ни будь,скажите мне, долго ли он проработает и имеет ли смысл это для системного ssd?

[Programma_Boinc]

Обновление исследования от команды MCM (май 2024 г.)

[Programma_Boinc]

Доступна новая версия BOINC (8.0.2).


Загрузите клиентское программное обеспечение BOINC


Страницазагрузки
https://boinc.berkeley.edu/download_all.php


ПРИМЕЧАНИЕ.
Для версий до 7.18 может потребоваться обновление файлапакета CA для связи с некоторыми проектами. Вы также можете скачать исполняемыефайлы с GitHub.
https://boinc.berkeley.edu/ca_bundle.php
https://boinc.berkeley.edu/wiki/Github_download

[Programma_Boinc]

Обновлениеисследований от команды MCM (июль 2024 г.)

Мы продолжаем характеризовать биомаркеры рака легких,выявленные в проекте MCM1. Это обновление фокусируется на ASTN2, белке,участвующем в миграции нейронов. Он экспрессируется в нескольких типах тканей иучаствует в различных видах рака.


Проект: Картирование маркеров рака
https://www.worldcommunitygrid.org/r...m1/overview.do


Опубликовано: 10 июля 2024 г.


Терминология

- Аномалия Киари I типа: порок развития, при котором частьмозга выпячивается через нормальное отверстие в черепе, где она соединяется соспинномозговым каналом, оказывая давление на головной и спинной мозг.
- Хроническая обструктивная болезнь легких (ХОБЛ): группазаболеваний, вызывающих закупорку дыхательных путей и проблемы, связанные сдыханием.
- Глиобластома: тип рака, который образуется из клеток,называемых астроцитами, в головном или спинном мозге.
- Астроциты: тип клеток в центральной нервной системе,которые играют множество важных ролей в поддержке нейронов.


Предыстория

Определение молекулярных маркеров и их комбинаций (сигнатур)позволяет нам выявлять заболевания на ранних стадиях (диагностическиесигнатуры) и стратифицировать пациентов на подгруппы на основе моделейпрогрессирования заболевания (прогностические сигнатуры). Последняя группамаркеров помогает определить, каким пациентам будут полезны определенныеварианты лечения (прогностические сигнатуры). Проект Mapping Cancer Markersанализирует наборы данных с миллионами точек данных, собранных у пациентов сраком, для поиска таких диагностических, прогностических и предсказательныхсигнатур.


С ноября 2013 года волонтеры World Community Gridпожертвовали более 905 700 процессорных лет проекту, помогая анализироватьданные о раке легких и яичников и саркоме гораздо тщательнее, чем это было бывозможно в ином случае. Мы безмерно благодарны за эту постоянную поддержку.


Сосредоточившись на характеристике 26 наиболее частовстречающихся генов при раке легких, мы уже обсуждали VAMP1, FARP1, GSDMB,ADH6, IL13RA1, PCSK5, TLE3, HSD17B11 и KLF5 в предыдущих обновлениях MCM. Здесьмы излагаем информацию об ASTN2.


Исследование ASTN2

ASTN2 (Astrotactin-2) — это белок, который опосредуетрециркуляцию ASTN1 (Astrotactin-1), молекулы адгезии нейронных клеток. Этотпроцесс включает в себя содействие интернализации ASTN1 обратно в нейрон иобеспечение его транспортировки по нейрону во время миграции нейронов(Uniprot).


Учитывая роль ASTN2 в центральной нервной системе, понятно,что он участвует в эмоциональных и когнитивных функциях. Данные свидетельствуюто том, что ASTN2 играет роль в расстройствах, связанных с мозгом и познанием, такихкак болезнь Альцгеймера, психиатрические расстройства, умственная отсталость,восприимчивость к мигрени и мальформация Киари I типа.


При этом ASTN2 имеет низкую тканевую специфичность иэкспрессируется во всех типах тканей, исследованных в Атласе белков человека.Соответственно, ASTN2 вовлечен в функцию почек, эндометриоз, остеоартрит, кардиометаболическиепризнаки и хроническую обструктивную болезнь легких (ХОБЛ). Интересно, что этасвязь с ХОБЛ является специфической для женщин. Потенциальная роль ASTN2 в ХОБЛзаслуживает внимания, поскольку исследования показали, что ХОБЛ и рак легкихтесно связаны на молекулярном уровне.
Рисунок 1. Экспрессия ASTN2 в различных типах тканей (Атласбелков человека).


В соответствии с другими представленными нами генами,высокая экспрессия ASTN2 связана с более длительной выживаемостью при раке легких(Рисунок 2A). Примечательно, что эта связь присутствует только у женщин(Рисунок 2B), а не у мужчин (Рисунок 2C).


Рисунок 2. (A) Кривые выживаемости для пациентов с ракомлегких с низкой и высокой экспрессией ASTN2 (KMplot), (B) только для женщин и(C) только для мужчин.


Хотя наше внимание сосредоточено на раке легких, мыдополнительно изучили, связан ли ASTN2 также с другими типами рака. Какпоказано на рисунке 3, сравнивая раковые ткани с нормальными тканями, ASTN2дифференциально экспрессируется в 13 из 22 проанализированных видов рака(обозначено красным текстом). Примечательно, что ASTN2 повышается в 8 из этихвидов рака, тогда как снижается только в 5.


В литературе связь между ASTN2 и раком, по-видимому,недостаточно изучена, и опубликовано очень мало статей по этой теме. Однакоодно исследование предположило, что ASTN2 связан с функцией легких, а другоеисследование показало, что экспрессия ASTN2 повышена в клеточных линияхглиобластомы по сравнению с нормальными человеческими астроцитами.


Рисунок 3. Экспрессия ASTN2 в нормальной и раковой ткани длянескольких типов рака. Красный текст представляет собой значительную разницумежду экспрессией в раковой ткани по сравнению с нормальной тканью (TNMplot).


Если у вас есть какие-либо вопросы или комментарии,пожалуйста, оставляйте их в этой теме, чтобы мы могли ответить!


Команда поддержки WCG
https://www.worldcommunitygrid.org/a...?articleId=813


Хотите принять участие в распределенных вычислениях, тогда,Вам сюда:
https://boinc.ru
https://www.proteinatlas.org/ENSG000...9-ASTN2/tissue

[Programma_Boinc]

19 июня 2024 года, обобщенный поиск простых чисел Ферма PrimeGrid обнаружил мегапростое число:

10913140^524288+1

Простое число состоит из 3 689 913 цифр и войдет в «Самую большую базу данных известных простых чисел», заняв 11-е место среди обобщенных простых чисел Ферма и 81-е место в целом.
https://t5k.org/primes

Открытие было сделано Генрихом Подсадой (PoHeDa) из Германии с использованием NVIDIA GeForce RTX 3070 в 16-ядерном процессоре AMD Ryzen 9 5950X с тактовой частотой 3,40 ГГц и 64 ГБ оперативной памяти под управлением Microsoft Windows 11 Professional x64 Edition. Этому компьютеру потребовалось около 50 минут, чтобы выполнить тест на вероятное простое число (PRP) с использованием Genefer23. Генрих Подсада — член команды SETI. Germany.

PRP был подтвержден 20 июня 2024 года на процессоре AMD Ryzen 9 5950X с тактовой частотой 3,4 ГГц и 128 ГБ ОЗУ под управлением Linux Mint 20.3. Этому компьютеру потребовалось около 15 часов 56 минут, чтобы пройти тест на простоту с использованием LLR.

Более подробную информацию можно найти в официальном объявлении.
https://www.primegrid.com/download/G...140_524288.pdf

[ULLICTUK]

фига как обычный майнинг замаскировал

[Programma_Boinc]

А мне в свою очередь, очень приятно осознавать, что я могу помогать людям и пускай даже порой я не получу за это денег.
www.boinc.ru

[Programma_Boinc]

Запустим ламу на домашнем кластере.


Llama 3.1 405B, квантизированная до 4 бит, запущенная надвух макбуках (128 гиг оперативки у каждого). Возможно это с помощью exo -тулы, позволяющей запускать модельку распределённо на нескольких девайсах.Поддерживаются практически любые GPU, телефоны, планшеты, макбуки и почти всё очём можно подумать.
(https://x.com/ac_crypto/status/1815969489990869369)
Запустить ламу на домашнем кластере (https://github.com/exo-explore/exo)

[Programma_Boinc]

27 июля 2024 года, 09:18:10 UTC,

функция Primorial Prime Search от PrimeGrid обнаружила Primorial Prime: 4328927#+1

https://t5k.org/primes

Простое число состоит из 1 878 843 цифр и войдет в «Самую большую базу данных известных простых чисел», заняв 1-е место среди первичных простых чисел и 373-е место в целом.

Открытие было сделано Каем Преслером (Aperture_Science_Innovators) из Антарктиды с использованием процессора Intel(R) Xeon(R) E7-8890 v4 @ 2,20 ГГц с 256 ГБ оперативной памяти и Linux Mint 21.1.

http://www.primegrid.com/show_user.php?userid=1654901
http://www.primegrid.com/team_display.php?teamid=1710

Этому компьютеру потребовалось около 6 часов 53 минут, чтобы выполнить тест на вероятное простое число (PRP) с использованием PRST.

Кай Преслер — член команды [H]ard|OCP.

PRP был подтвержден 29 июля 2024 года на процессоре AMD Ryzen 9 7950X3D с тактовой частотой 4,20 ГГц и 128 ГБ ОЗУ под управлением Debian 12.5.

Этому компьютеру потребовалось около 2 дней 3 часов 38 минут для завершения теста на простоту с использованием PGFW с 4 потоками. Более подробную информацию можно найти в официальном объявлении.
https://www.primegrid.com/download/PRS-4328927.pdf

[Programma_Boinc]

Проект распределённых вычислений LODA снова запущен после временного перерыва.

Этот проект занимается поиском оптимальных программ на ассемблере, которые будут вычислять числовые последовательности. Присоединяйтесь!

Для работы проекта в системе должен быть установлен Git а также BOINC должен быть установлен как приложение (а не как служба).
Вот адрес проекта: https://boinc.loda-lang.org/loda/

[ULLICTUK]

Сообщение от Programma_Boinc:

Этот проект занимается поиском оптимальных программ на ассемблере, которые будут вычислять числовые последовательности. Присоединяйтесь!

блокчейны

[Programma_Boinc]

Сейчас, на ближайший 2025 год, из проектов распределённых вычислений наибольший интерес представляют следующие два (оба отечественные):

1) Gerasim@Home там поставлена конкретная конечная задача досчитать 7 поле Галуа. Сейчас уже посчитано 20 процентов. Осталось 383 дня при текущей мощности. Проект может считать на видеокартах AMD и NVidia - так что видеокарты можно отдать на Gerasim@Home

2) RakeSearch там исследуются свойства латинских квадратов. Конечной точки пока нет. Там автором постоянно ставятся новые задачи. Но проект интересен тем, что автор постоянно после каждого небольшого исследования делает публикации, выступает на конференциях. Проект умеет считать только на центральных процессорах.

Так что сейчас центральные процессоры можно отдать RakeSearch, а видеокарты Gerasim@Home
Сайт проекта: http://gerasim.boinc.ru
Сайт проекта - https://rake.boincfast.ru/rakesearch/

[Programma_Boinc]

В отечественном проекте распределённых вычислений RakeSearch важное достижение!!!

Завершён масштабный 6-летний эксперимент по поиску ОДЛК порядка 10 в окрестностях обобщенных симметрий в парастрофических срезах, полученные результаты постобработаны и проанализированы, можно подводить первые итоги, читать подробнее:

https://boinc.ru/forum/topic/proekt-...94#postid-9281

[Programma_Boinc]

Обновлениеперезапуска Africa Rainfall Project

https://www.worldcommunitygrid.org/r...p1/overview.do


Проект ARP будет перезапущен в понедельник 4 ноября послетехнической паузы, в которую он вошел в декабре 2022 года.


Проект: Africa Rainfall Project
Опубликовано: 31 октября 2024 г.


Предыстория

Africa Rainfall Project (ARP) направлен на моделированиеливней в странах Африки к югу от Сахары для улучшения региональных прогнозовпогоды. Цель состоит в том, чтобы запустить моделирование погоды с высокимразрешением (1 км) для всего региона в течение одного года.
Предоставление точных прогнозов погоды имеет решающеезначение для самодостаточности местного фермерского сообщества. Сравниваярезультаты, полученные путем вычисления данных об осадках из различныхисточников с использованием World Community Grid, ученые могут создавать всеболее точные прогнозы, улучшать будущие моделирования и, в свою очередь,прогнозы погоды.


В декабре 2022 года проект был поставлен на техническуюпаузу из-за ограничений емкости их системы хранения, размещенной в национальнойустановке HPC в Нидерландах. Более подробную информацию об ограничениихранилища и подробных шагах, необходимых для перезапуска проекта, можно найти внашем предыдущем обновлении за апрель.
https://www.worldcommunitygrid.org/a...?articleId=811


Обновлениеперезапуска ARP

Ранее команда ARP размещала на своих серверах в TU Delft всескрипты, данные и скомпилированные приложения, необходимые для подготовкивходных данных для новых рабочих единиц.


Команда ARP предоставляла нам эти новые входные данные длязагрузки, чтобы мы могли подготовить следующее поколение рабочих единиц ипроиндексировать их в BOINC.
Вывод завершенных рабочих единиц, отправленный намволонтерами, а затем от нас в TU Delft, был необходим, но недостаточен дляподготовки следующего поколения рабочих единиц.


Необходимо выполнить ряд шаговпредварительной обработки, которые ссылаются на исходные метеорологическиеданные и данные о температуре поверхности, и это конвейер, который теперьразмещен на серверах WCG для перезапуска ARP1 после того, как команда ARPлюбезно предоставила весь код скриптов и данные, а также полезную документацию.


В результате WCG теперь находится в лучшем положении дляработы с научными группами по моделированию погоды в будущем. Мы такжеобсуждали возможное расширение до версии GPU программного обеспечения WRF снашим ведущим научным экспертом Ллойдом А. Трейнишем.
https://www.mmm.ucar.edu/models/wrf


Каждая подзадача проекта ARP1, отправленная волонтерам вкачестве рабочей единицы, отличается от других подзадач местоположением ивременем. Каждая рабочая единица моделирует погоду в подрегионе, называемомдоменом, и существует 35 609 перекрывающихся доменов, составляющих регион к югуот Сахары, для которого мы моделируем погоду с помощью приложения NCAR WeatherResearch Forecasting (WRF).


Каждый из этих доменов, чтобы завершить работу за разумноевремя на устройствах волонтеров, моделирует погоду в «поколениях», которыепредставляют собой просто 48-часовые интервалы, помеченные от 000 до 183, что всумме составляет год моделирования погоды для региона.


Поскольку выходные данные предыдущего поколения используютсяв качестве входных данных для следующего поколения, граница должна в конечномитоге синхронизироваться по всем доменам для выполнения общих вычислений.


Некоторые домены могут отставать, а некоторые кластерыдоменов, которые находятся достаточно далеко друг от друга, могут генерироватьнекоторые входы следующих поколений, не дожидаясь, пока их далекие соседидогонят. В прошлом мы теряли опыт предыдущего поколения, но перезапускмоделирования с начальных условий или контрольной точки возможен, и мы обычноназначаем более высокий приоритет этим рабочим единицам в BOINC, пока недогоним.


Рисунок 1. Прогресс в моделировании прогноза погоды длякаждого субрегиона Африки к югу от Сахары. Дата начала моделирования на одингод — 01.07.2018, а конец — при расчете данных за 30.06.2019.


Теперь мы можем использовать результаты, которые мы накопиливо время перехода на хранилище в Делфтском техническом университете, и снованачать генерировать входные данные для следующего поколения рабочих единицARP1.


В большинстве случаев мы сможем продолжить с того места, накотором остановились, в ведущем поколении (большая часть которого находитсямежду 130 и 140), и со временем, благодаря полной автоматизации сценариев, мысможем подготовить постоянный поток рабочих единиц ARP1.


Благодарим команду ARP за постоянное партнерство с WCG.Благодарим всех волонтеров, которые помогли обработать первую фазу проекта, изаранее благодарим всех тех, кто поможет нам довести проект ARP до успешногозавершения.
Команда WCG


Хотите принять участие в распределенных вычислениях, тогда,Вам сюда:
https://boinc.ru
Ссылка на телеграмм https://t.me/TSCRussia

[Programma_Boinc]

С 13 ноября 07:00 по 20 ноября 07:00 PrimeGrid будет проводить 7-дневный конкурс по проекту PSP (Prime Sierpinski Problem LLR). Обратите внимание на необычное время начала и окончания!

Для получения дополнительной информации см. эту ветку форума.

https://www.primegrid.com/forum_thread.php?id=10696

[Programma_Boinc]

Мои дорогие друзья,
Более 10 лет я занимаюсь проектом Universe@Home.
К сожалению, после смерти профессора Кшиштофа Бельчинского мы не смогли найти способ продолжить проект. Поэтому, поскольку финансирование закончилось в конце августа этого года, я формально больше не связан с проектом.
Все еще надеясь, что будет найдена научная группа для дальнейшего развития, я продолжал заниматься текущим обслуживанием сервера и намерен продолжать заниматься этим в свободное время, пока либо не будет найден преемник Кшиштофа, либо пока CAMK не решит закрыться. вниз по серверам.
Мне искренне жаль, что столь долгая история нашей совместной работы подходит к концу. К сожалению, мне не хватает научных знаний, необходимых для продолжения исследований самостоятельно.
Я хотел бы поблагодарить всех вас за многолетнюю поддержку и выразить надежду, что когда-нибудь мы сможем снова встретиться над другим проектом, которым я смогу управлять со стороны BOINC.
Кшиштоф 'krzyszp' Пищек
Член команды Radioactive@Home https://bit.ly/3uYcNqW
Мой Профиль на Патреоне https://bit.ly/3BzScvt
Universe@Home на YouTube

YouTube (short)

[Programma_Boinc]

Использованиетехнологий во благо: как Сойер и Бретт Томпсон переосмысливают исследованиярака

Опубликовано: 8 ноября 2024 г.


Когда у Бретта Томпсона диагностировали рак мозга, это сталоразрушительной новостью для его семьи. Но из этого кризиса вытекла необычнаяреакция его тогдашнего 12-летнего сына Сойера Томпсона, который использовалсвою любовь к технологиям, чтобы присоединиться к борьбе с раком неожиданнымобразом. Сегодня их история вдохновляет людей по всему миру переосмыслить, какони тоже могут внести свой вклад в научные исследования, даже без специальныхзнаний или средств.


Путь Сойера начался с простого поиска в интернете, движимогожеланием помочь отцу любым возможным способом. «У меня не было денег, чтобыпожертвовать, не было знаний о том, как вылечить рак. Я чувствовал себябессильным», — вспоминает он.


Его исследования привели его к World Community Grid,новаторской инициативе, которая позволяет отдельным лицам вносить свободнуювычислительную мощность для поддержки ученых с ресурсоемкой обработкой данных.Созданная IBM в 2004 году и позже переданная в Исследовательский институтКрембила в Торонто, эта платформа использует мощность тысяч домашнихкомпьютеров для выполнения вычислений с большим объемом данных за малую частьвремени и затрат, которые потребовались бы на обычных суперкомпьютерах.


Увидев потенциал, Сойер запустил Sawyer's Cancer FightingNetwork и привлек членов семьи, друзей и даже незнакомцев онлайн дляпожертвования неиспользуемой вычислительной мощности.


Просто запустив фоновое приложение на своих компьютерах, егосеть добровольцев могла помочь обработать огромные объемы данных, необходимыедля исследования рака. Его первоначальной целью было создать 100-летнюювычислительную мощность за один год. К его удивлению, он превзошел эту цель задва месяца благодаря подавляющей поддержке мирового сообщества. По мерераспространения информации к инициативе Сойера присоединилось большедобровольцев, что помогло ему достичь 1000 лет вычислительного времени кследующему дню рождения его отца. Сегодня его сеть из 208 добровольцев внеслаэквивалент более 1870 лет обработки данных в исследования рака.


Влияние усилий Сойера выходит далеко за рамки его семьи. Егосеть сыграла важную роль в продвижении проекта Mapping Cancer Markers Project,который фокусируется на выявлении маркеров, связанных с раком. Доктор ИгорьЮришица, старший научный сотрудник Научно-исследовательского институтаКрембиля, своими глазами увидел, какую разницу дает такая поддержка.


«Как ученые, мы часто сталкиваемся с вычислительнымизадачами, превышающими доступные нам вычислительные мощности», — объясняетдоктор Юришица. «Встреча с Томпсонами была для нас смирением; она напомнила намо влиянии, которое могут оказать наши исследования, когда такие люди, какСойер, объединяют людей, которым не все равно».


Ускоренный прогресс проекта — позволил команде изучить раклегких, рак яичников и расширить его, чтобы понять саркому — что позволилополучить новые результаты для улучшения лечения и профилактики рака.


Семья Томпсонов недавно приехала из своего дома вВашингтоне, округ Колумбия, в Торонто, где они посетили исследовательскиецентры Крембиля и встретились с учеными, которых они поддерживают.


Для Сойера этот опыт оживил цель его усилий. «Исследования —это то, что дает энергию для новых открытий, и они нужны нам больше, чемкогда-либо», — говорит он, восхищаясь передовыми микроскопами и технологиямивизуализации в Центре передовой оптической микроскопии Крембиля. Главныммоментом визита стало то, что он поделился с исследователями 3D-печатноймоделью мозга своего отца, уникальным и сентиментальным подарком, который онсделал из снимков МРТ после того, как опухоль Бретта была удалена. Бретт,который описывает модель как смесь «юмора об опухолях» и любви, считает, чтоона символизирует силу, которую его семья обрела среди своих испытаний.


Размышляя о том, как далеко они продвинулись, Бретт делится,как глубоко он тронут преданностью Сойера. «Это началось, как способ помочьмне, но переросло в то, что помогает многим другим», — говорит он с очевиднойгордостью.


Действительно, то, что начиналось как личное усилие, сталообъединяющим кличем для семей по всему миру, пострадавших от рака. Одинволонтер, известный под именем пользователя «Old Chap», присоединился к командеСойера после того, как ему поставили диагноз, олицетворяя дух сообщества,который вдохновлял Сойера.


По мере того, как развивается путь Сойера, развивается и еговидение будущего. Он продолжает искать способы использования технологий дляобщественного блага. В 18 лет он расширил свою работу от организации сетиволонтерских компьютеров до создания веб-сайтов, разработки ботов и содействияусилиям по борьбе с пандемией, включая платформу, помогающую людям находитьзаписи на вакцинацию от COVID-19. «Настоящая сила технологий — это не скоростьили что-то в этом роде», — размышляет Сойер, — «а то, как вы используете их,чтобы оказать положительное влияние на мир».


Для тех, кто вдохновлен пойти по стопам Сойера,присоединиться к World Community Grid легко. Посетив Sawyer’s Cancer FightingNetwork, волонтеры могут зарегистрироваться, загрузить приложение и статьчастью всемирного движения, которое превращает обычные компьютеры в инструментыдля выдающихся научных достижений. Как показывает успех Сойера, каждый можетстать частью решения некоторых из самых больших мировых проблем, по одномувычислительному циклу за раз. Эта вдохновляющая история также заинтриговала репортераCity News Фаизу Амин, которая взяла интервью у Сойера и его отца.


https://toronto.citynews.ca/video/20...ancer-research
https://www.helpsawyerfightcancer.com/


Хотите принятьучастие в распределенных вычислениях, тогда, Вам сюда:
https://boinc.berkeley.edu/wiki/Simple_view
https://boinc.berkeley.edu/download_all.php
https://boinc.ru
Ссылка на git-хаб, где лежат исходники программы-клиентаBOINC.
https://github.com/BOINC/boinc
Ссылка на телеграмм https://t.me/TSCRussia

[ReindeeR]

Сообщение от Programma_Boinc:

после смерти профессора Кшиштофа Бельчинского

Сообщение от Programma_Boinc:

преемник Кшиштофа

Сообщение от Programma_Boinc:

Кшиштоф 'krzyszp' Пищек

[Programma_Boinc]

World Community Grid исполнилось 20 лет!


В этом ноябре мы отмечаем двадцатую годовщину WorldCommunity Grid (WCG), инициативы, которая задействовала простаивающиевычислительные мощности компьютеров волонтеров по всему миру для продвижениякритически важных научных исследований.


Опубликовано: 16 ноября 2024 г.


Запущенный в 2004 году IBM, WCG начинался как амбициозныйпроект по мобилизации свободных вычислительных мощностей для решения глобальныхпроблем в области здравоохранения, бедности и устойчивого развития. Запоследние два десятилетия он оказал огромное влияние, достигнув миллионовпроцессорных лет вычислений в различных исследовательских проектах на благочеловечества. Сегодня Jurisica Lab в Научно-исследовательском институтеКрембиля, часть University Health Network (UHN), продолжает продвигать миссиюWCG, развивая наследие IBM, расширяя ее охват и фокус.


Почему WCG?

Все большие объемы данных генерируются в лабораториях повсему миру в самых разных дисциплинах. Для анализа этих данных требуются всеболее мощные (и дорогие) компьютеры, что заставляет исследователей либонаходить масштабируемые решения, либо изменять исследовательские вопросы, накоторые мы можем себе позволить ответить. Сетевые вычисления обеспечиваютрешение многих из этих проблем, поскольку они разделяют проблему на болеемелкие задачи, которые распределяются по компьютерам, которые также постояннообновляются.


WCG работает на стыке гражданской науки, открытых данных ивычислительной биологии. Он дает возможность отдельным лицам вносить вклад впередовые исследования из собственных домов или с работы, предоставляяисследователям вычислительную мощность, необходимую для анализа огромныхнаборов данных и поиска ответов на некоторые из самых насущных вопросов, скоторыми сталкивается человечество. Эта приверженность продвижению научныхоткрытий привела к достижениям, ранее невообразимым с помощью обычных ресурсов.


Когда?

Как подробно описано в нашей предыдущей новостной статье,World Community Grid вышла в сеть в 2004 году с миссией решения проблемобщества путем использования свободных вычислительных мощностей мира. IBMпожертвовала оборудование, программное обеспечение, технические услуги иподдержку хостинга для создания и запуска World Community Grid. Это была перваяв своем роде благотворительная модель, использующая пожертвованнуювычислительную мощность компьютеров от обычных людей для решения многихисследовательских вопросов в рамках отдельных проектов.


В сентябре 2021 года право собственности на World CommunityGrid было передано Jurisica Lab в Научно-исследовательском институте Крембила.Хотя переход был долгим, и путь был немного трудным, небольшаяисследовательская группа, которая заменила большую корпоративную команду,сделала все возможное и продолжает вкладывать время и энергию в продолжениеважного наследия и поддержки исследований, предоставляемых WCG. Будучи частьюкрупнейшей в Канаде больничной исследовательской организации, Jurisica Labнамерена использовать инфраструктуру WCG для ускорения открытий в областихронических заболеваний, включая рак, артрит и неврологические расстройства.Проекты, поддерживаемые WCG сегодня, добиваются успехов в новых областях,включая исследования артрита, где вычислительная мощность ускоряетидентификацию биомаркеров, и нейродегенерации, где основное внимание уделяетсяновым стратегиям лечения.


Что?

Сетка была вдохновлена ​​ранними проектами, такими какSmallpox Research Grid, которая объединила более двух миллионов добровольцев из226 стран для обработки более 35 миллионов молекул лекарств, для Министерстваобороны США. Благодаря этим усилиям IBM и United Devices стали пионерами моделидля глобальных краудсорсинговых исследований, которая с тех пор развилась длярешения еще более широких социальных проблем.


С тех пор 32 проекта получили поддержку волонтеров WCG.Борьба с раком, СПИДом и COVID-19 была той, которая получила самую сильнуюподдержку со стороны волонтеров. Все исследователи очень благодарны за обширнуюподдержку, оказанную всем этим проектам.


Несколько проектов завершили свою первую фазу в 2024 году,включая OPN1, HSTB и SCC, и перешли на этапы проверки. По состоянию на ноябрь2024 года единственными активными проектами являются Mapping Cancer Marker иAfrican Rainfall Projects, но скоро появятся новые. (Следите за новостями!)
Рисунок 1. Годы ЦП,пожертвованные волонтерами на проект в год.

Кто?

За 20 лет к Grid присоединилось множество волонтеров.Удивительно, но к 16 ноября 2004 года к WCG присоединились 364 волонтера,которые в течение 20 лет оставались активными участниками, что стало основойдля 814 834 волонтеров с 7 689 637 устройствами.


Известные организации также зарегистрировались в самомначале, включая Национальные институты здравоохранения, клинику Майо,Оксфордский университет, Благотворительный фонд Дорис Дьюк, Фонд рынка,Всемирную организацию здравоохранения и Программу развития ООН.


Научный центр имени Рубена Х. Флита, популярнаядостопримечательность Сан-Диего, стал первым культурным учреждением,присоединившимся к World Community Grid.


WCG также привлекла Ассоциацию тенниса США во времяОткрытого чемпионата США 2005 года.
По состоянию на ноябрь 2024 года участники в совокупностипожертвовали 2 618 517 лет вычислений, а 31 доброволец получил более 1миллиарда кредитов. Спасибо.


Где?

Волонтеры WCG приезжают со всего мира, как показано нарисунке 2. Хотя в США насчитывается наибольшее количество волонтеров, внескольких странах Европы и Азии насчитывается тысячи волонтеров.


Рисунок 2. Количествоволонтеров в каждой стране, как они сами заявляют.

Хотя в некоторых странах всего несколько волонтеров,некоторые из них жертвуют огромные объемы вычислений на одного добровольца. Вэтом случае, в тройку лидеров входят Каймановы острова, где 3 пользователя всреднем предоставляют более 164 миллионов кредитов на одного добровольца;острова Теркс и Кайкос, где только 1 доброволец самостоятельно жертвует более161 миллиона кредитов!; и Ангилья, где 4 волонтера в среднем предоставляютболее 103 миллионов кредитов на одного добровольца. Какой пример преданностиделу!


На рисунке 3 представлена​​карта, центрированная на трех странах, указанных выше, и среднее количествокредитов на одного волонтера в странах, представленных на карте.
Рисунок 3. Вид картымира, показывающий ведущие страны по среднему количеству кредитов на одноговолонтера.
Спасибо всем волонтерам, которые внесли свой вклад иподдержали WCG. Это было бы невозможно без всех вас!


Хотите принятьучастие в распределенных вычислениях, тогда, Вам сюда:
https://boinc.berkeley.edu/wiki/Simple_view
https://boinc.berkeley.edu/download_all.php
https://boinc.ru


Ссылка на git-хаб,где лежат исходники программы-клиента BOINC.
https://github.com/BOINC/boinc
Ссылка на телеграмм https://t.me/TSCRussia
https://www.worldcommunitygrid.org/a...?articleId=763
https://www.worldcommunitygrid.org/a...?articleId=816

[ULLICTUK]

Сообщение от Programma_Boinc:

Министерстваобороны США

ну вот, работа на потенциального врага.

а в наще время уже реального.

[Programma_Boinc]

Молекулярныйавтомат


Подумал-подумал и решил, что первоначальную заметку (к томуже, написанную "для тех, кто уже участвует"), стоило бы дополнить.

Итак, в чём суть проблемы? Любой вирус - этомолекулярный автомат. Это программа, воплощённая в нескольких слоях молекулобразующих оболочку и начинку из РНК или ДНК.
Например - как у упоминаемого вируса Зика. Если вокругхолодно - это просто крупинка вещества. Но при подходящей температуре пристолкновении с клеткой, молекулы белков его оболочки вступают в химическуюреакцию с белками клеточной мембраны, "разрезают" её, внутрь клеткипопадает РНК или ДНК вируса и запускается её реплицирование механизмами,существующими в клетке.
Заразив клетку, вирус превращает её в "молекулярный 3D-принтер"создающий новые копии вируса, которые, в итоге, выходят из разрушенной клетки,продолжая заражение.

Как с этим бороться? Нужно найти вещество,которое бы либо разрушало вирус, либо как-то осложняло работу его механизмов,чтобы иммунная система уже сама его окончательно бы уничтожила. При этом, этовещество не должно уничтожать все остальные живые клетки в округе, убиваяорганизм, который надо вылечить.

Где такие вещества искать? Используя таблицуМенделеева и известные законы природы, можно создать много, очень многоразличных химических соединений. В зависимости от требований, уже посленекоторого "просеивания" их можно получить как просто"много" - например 10^20 (десять в двадцатой степени), так и в числе,сама запись которого будет для нас непривычна - 10^60, 10^90 и т.д. Существуюти специально составленные базы с соединениями, "перспективность"которых лучше, чем какого-то совсем уж случайно сгенерированного наугад.

Используя законы Физики и Химии можно смоделировать взаимодействие молекул проверяемогосоединения с молекулами мембраны вируса и понять - может ли оно его уничтожитьили нейтрализовать.

А самое замечательное в том, что для подобного моделирования не требуетсябольших вычислительных мощностей. Оно может быть выполнено в виде отдельнойзадачи, работающей на одном ядре более-менее современного компьютера в течениенескольких часов. А поскольку процессоры подавляющего большинства домашнихкомпьютеров, ноутбуков, планшетов и смартфонов, на самом деле, от 90 до 99%времени не делают ничего (можете проверить, запустив диспетчер задач), то дажезапуская такую задачу в фоновом режиме и с самым низким приоритетом (чтобы онаникак не мешала любым другим задачам в части задействования процессора) – можнополучить огромные вычислительные мощности для проверки большого числа такихсоединений. Если в этом деле будет участвовать какое-то большое число людей,которым наука интересна на самом деле.

И, (как легко понять из исходной новости) – конечно участвуют. И в разныхпроектах. Открывают радиопульсары, интересные математические конструкции, ищутлекарства, моделируют Вселенную, прочёсывают данные LIGO (да, тех самыхгравитационно-волновых обсерваторий которые и поймали впервые гравитационные волны,принеся Кипу Торну Нобелевскую премию) в поиске гравитационные волн уже от несливающихся, а от одиночных объектов, моделируют климат… и много чего ещё!

А иногда – с некоторой грустью и удовлетворением от выполненной работы (пустьона делается компьютером и в фоновом режиме) – провожают завершившиеся проекты.Да, вычисления идут сами – их надо только запустить и, участие в проекте – этоне строительство Симплонского туннеля. Но что-то общее – есть. Пожалуй –масштаб!

P.S. Вы дочитали до конца? И вам действительно интересна наука? Тогда, возможно– вы такой же как и мы! Запускайте вычисления – [https://vk.com/page-34590225_52622420 ],присоединяйтесь к группе нашей команды - [https://vk.com/crystal_dream_team ],задавайте вопросы в группе и заходите на форум BOINC.Ru –[https://boinc.ru/forum/ ]!

[Programma_Boinc]

Два проекта, SmashChildhood Cancer и Help Stop TB подходят к концу.

Smash Childhood Cancer и Help Stop TB завершили свою фазувычислений с WCG и предоставляют нам последние новости.


Проекты: Помогите остановить туберкулез, разгромить детскийрак.


Опубликовано: 26 ноября 2024 г.


Доктор Келлер изпроекта Smash Childhood Cancer написал нам:

"Институт развития детской онкологической терапииблагодарен Volunteers of the World Community Grid за возможность реализациипроектов в сотрудничестве с доктором Тюдзи Хосино из Университета Тиба, Япония.


Самым ярким моментом этого сотрудничества стало то, что нашпроект теперь является частью проекта Cancer Research UK Cancer Grand ChallengeKOODAC стоимостью 25 млн. долларов США с MIT, Institut Curie, University ofDundee, Nurix Therapeutics и другими по разработке терапевтических средств длялечения детской саркомы на основе белковых деградаторов.


Программа Smash Childhood Cancer WCG также стала научнойосновой нескольких проектов летних стажировок, продвигая методы лечениядетского рака и готовя разнообразную группу молодых людей к карьере в областинауки и медицины".


Всего наилучшего команде в их будущих исследованиях.


Доктор Крофт изпроекта Help Stop TB написал нам:

«Хотя проект в последнее время не был активен для новыхрасчетов, мы выполняли работу за кулисами, чтобы завершить расчеты, которые унас есть, и подготовиться к сообщению результатов. Это включало исследованиеновых методологий XAI (объяснимый ИИ — не методы «черного ящика», а те, которыеговорят нам о том, почему принимаются решения) для обработки нашихотличительных наборов данных.


Поскольку миколовые кислоты уникальны по своему поведению измолекул, изученных в литературе на сегодняшний день, это означало большеработы, чем ожидалось, но мы надеемся, что вскоре все будет проанализировано спомощью новых методов.


Более того, мы искали, как повторно применить некоторые изэтих методов к аналогичным сложным системам в других новых проектах группы,таких как применение к новым биологическим препаратам, чтобы лучше понять ихсвойства и оптимизировать производство — следите за этим пространством.


Однако, как это происходит в текущем проекте, похоже, что мыне сможем получить новые расширенные системы для следующего расчета и поэтапнозапускаем в сроки, на которые мы изначально надеялись. Поэтому мы принялирешение отложить новые расчеты до тех пор, пока у нас не появится выделенныйисследователь для надзора за работой, и мы сосредоточимся на завершении того,что у нас есть.


Между тем, мы хотели бы поблагодарить всех волонтеров,которые были с нами в течение последних многих-многих лет, и их неизменнуюподдержку проекта. Мы надеемся, что сможем предоставить вам подробнуюинформацию о результатах и ​​последствиях вашего вклада в ближайшембудущем."


Мы также желаем команде доктора Крофта всего наилучшего в ихбудущих начинаниях.


https://www.worldcommunitygrid.org/r...t1/overview.do
https://www.worldcommunitygrid.org/a...?articleId=817


Хотите принять участие в распределенных вычислениях, тогда,Вам сюда:
https://boinc.berkeley.edu/wiki/Simple_view
https://boinc.berkeley.edu/download_all.php
https://boinc.ru
Ссылка на git-хаб, где лежат исходники программы-клиентаBOINC.
https://github.com/BOINC/boinc
Ссылка на телеграмм https://t.me/TSCRussia

[Programma_Boinc]

Собрание и лекция натему проектов распределённых вычислений и гражданской науки.

Очень важное значимое событие произошло в астрономическомклубе ПетрГУ - там было собрание и лекция на тему проектов распределённыхвычислений и гражданской науки.


Проекты гражданской науки - это когда не компьютеравтоматически обрабатывает данные, а когда сам человек за компьютером выполняетчасть задания проекта, анализирует, систематизирует данные и отправляетрезультат.


Подробнее о мероприятии и ссылки на проекты гражданскойнауки здесь: https://vk.com/wall-2047015_6444
Вчера прошла очередная встреча нашего клуба, где основнойтемой стала гражданская наука!
Мы прослушали рассказ Ивана Терентьева о его опыте по поискуэкзопланет вместе с PlanetHunters, а также поговорили и о других проектах вгражданской науке, где могут принять участие все желающие!


В приложении фрагмент лекции Ивана Терентьева (удалосьзаписать лишь небольшую часть).
Презентация доступна по ссылке:
https://drive.google.com/file/d/1aEO...ew?usp=sharing


⭐Вот несколько полезных ссылок попроектам:
- PlanetHunters
https://www.zooniverse.org/projects/...t-hunters-tess
- Люди науки (различные проекты по гражданской науке)
https://citizen-science.ru
- Классификация переменных звёзд GAIA
http://zooniverse.org/projects/gaia-...about/research
- Классификация галактик
https://www.zooniverse.org/projects/...er/galaxy-zoo/
https://galaxycruise.mtk.nao.ac.jp/en/index.html
- Поиски 9 планеты
https://www.zooniverse.org/projects/...rlds-planet-9/
- Сайт научного волонтерства
https://scistarter.org/
- Изучение климата Марса
https://www.zooniverse.org/projects/...tting-on-mars/
- Классификация звёзд
http://scope.pari.edu/
Приложения для обнаружения космических лучей:
- CREDO: https://credo.science/#/how-to-start
- Cosmicray app: https://cosmicrayapp.com/
- DECO: https://www-old.wipac.wisc.edu/deco/app
- CRAYFIS: https://github.com/crayfis
Хотите принять участие в распределенных вычислениях, тогда,Вам сюда:
https://boinc.berkeley.edu/wiki/Simple_view
https://boinc.berkeley.edu/download_all.php
https://boinc.ru
Ссылка на git-хаб, где лежат исходники программы-клиентаBOINC.
https://github.com/BOINC/boinc
Ссылка на телеграмм https://t.me/TSCRussia