22.04.2023, 07:32
|
#151 | |||
|
Re: Распределённые вычисления
РЕЗУЛЬТАТЫ ГЛУБОКОГОПОИСКА ВСЕГО НЕБА ПО ДАННЫМ LIGO O3
Опубликовано 20 апреля 2023 15:22:16 UTC Результаты нашего поиска непрерывных гравитационных волн повсему небу в общедоступных данных третьего сеанса наблюдений LIGO (O3) былиопубликованы на сервере препринтов arXiv: Deep Einstein@Home поиск непрерывныхгравитационных волн по всему небу в общедоступных данных LIGO O3. Рукопись внастоящее время находится в процессе рецензирования для публикации в TheAstrophysical Journal. https://arxiv.org/abs/2303.04109 В нашей публикации описывается обзор всего небаEinstein@Home для непрерывных гравитационных волн с частотами от 20 Гц до 800Гц с использованием последних данных LIGO. На сегодняшний день это самыйчувствительный поиск по всему небу в этом диапазоне. Поиск не выявил никакого гравитационно-волнового сигнала. Наосновании этого мы делаем выводы о населении нейтронных звезд в нашемгалактическом соседстве. Например, в пределах 100 парсеков (~ 330 световых лет)вокруг Земли нет нейтронных звезд, вращающихся со скоростью более 12 000 об /мин, с экваториальными горами размером более полумиллиметра; в противном случаемы, скорее всего, обнаружили бы их непрерывные гравитационные волны. Команда LIGO добавляет к данным поддельные непрерывныесигналы гравитационных волн для проверки. Параметры сигнала известны. В своемдиапазоне поиска наш поиск точно восстанавливает ложные сигналы. Это дает намдополнительную уверенность в чувствительности нашего поиска. На данный момент мы проводим дополнительный поиск пообщедоступным данным LIGO. Поскольку мы продолжаем добывать эти данные длянепрерывных волн, мы сердечно благодарим всех вас, кто делает эту работувозможной, жертвуя время работы своих компьютеров! Если вы хотите узнать больше, просто ответьте на эту новостьна нашем дискуссионном форуме. М. Алессандра Папа https://www.aei.mpg.de/continuouswaves 
|
|
30.04.2023, 12:35
|
#153 | ||||
|
Re: Распределённые вычисления
можно бесконечно складывать 2 и 2, чтобы понять как отправить человеков в другую галактегу или выличить рак
 а когда через 10000 лет мимокрокодящий Васян внезапно что-то придумает - попытаться примазаться и рассказать всем про успех супир вычисляторов. и продать биток
__________________
Quote:
|
|
14.05.2023, 07:57
|
#154 | |||
|
Re: Распределённые вычисления
Клуб грид-вычисленийДилана Буччи в SislerCyberAcademy
Опубликовано: 17 апр 2023 г. Киберакадемия старшей школы Sisler (Виннипег, Массачусетс)расширила свое партнерство с World Community Grid, открыв компьютерный клуб вчесть одного из своих покойных одноклассников. Они распространили информацию оWCG в своем местном сообществе, поскольку считают, что изучение грид-вычисленийв школе имеет много положительных результатов. World Community Grid — это мощная вычислительная платформа,которая позволяет общественности поддерживать крупномасштабную науку изсобственного дома или офиса. Сочетая индивидуальный вклад с вкладом крупныхорганизаций, WCG сокращает вычислительное время, необходимое ученым для ответана самые насущные вопросы мира. Кроме того, партнерство с университетами исредними школами позволяет проводить программы по работе с молодежью иобразовательные программы, которые помогают подготовить следующее поколение. World Community Grid уточняет определение партнеров WCG — отнаучных партнеров (университеты и исследовательские институты, выполняющиеисследовательские проекты в сети), до партнеров по финансированию (например,дистрибьюторов) и партнеров (например, групп добровольцев и организаций,предоставляющих неиспользуемые вычислительные ресурсы). Мы также стремимсярасширить наше сотрудничество со старшими школами. Киберакадемия старшей школы Sisler в Виннипеге, штат Мэн,Канада, уже много лет сотрудничает с WCG, не только предоставляя значительныевычислительные мощности, но и привлекая учащихся к пониманиювысокопроизводительных вычислений и науки, которую они обеспечивают. WCGбезмерно благодарна за их стремление поддерживать исследования, которые меняютмир, и делиться платформой со своим местным сообществом. Недавно мы взялиинтервью у инструктора SislerCyberAcademy Роберта Эспозито и ученика 12-гокласса Эрика Истера, чтобы обсудить, как они интегрировали гражданскую науку всвою учебную программу и студенческую культуру. Участие Сислера в WCG началось в 2015 году с проекта 9-гокласса, в котором учащиеся должны были настроить WCG на нескольких компьютерах.В 2018 году Дилан Буччи, ученик 10-го класса SislerCyberAcademy, решилприсоединиться к WCG. В дополнение к желанию поддержать цели WCG в оказаниипомощи в ранней диагностике рака, у Дилана была личная мотивация, посколькумногие из его семьи и друзей скончались от этой болезни. Он провел много часовсвоего свободного времени, реконфигурируя дюжину пожертвованных серверов, и втечение года он посвятил 168 лет обработки данных исследованиям рака WorldCommunity Grid (CTV newsWinnipeg). Он поделился своим энтузиазмом и интересом кWCG с другими студентами, и волонтерская база начала быстро расти. В 2019 годуДилан вместе с г-ном Эспозито стали первыми добровольцами, встретившимися сдоктором Юрисикой и командой MCM в Исследовательском институте Крембила вТоронто. Дилан Буччи, инструктор SislerCyberAcademy Роберт Эспозито идоктор Игорь Юрисика во время экскурсии по Исследовательскому институтуКрембиля К сожалению, в августе 2020 года у Дилана диагностировалисаркому Юинга 4 стадии — редкий тип рака, который возникает в костях или мягкихтканях вокруг них. Рак быстро метастазировал в его бедра, позвоночник, таз,ребра, легкие и далее вверх по руке. Несмотря на лечение и неустанную борьбу,Дилан скончался 19 февраля 2022 года в возрасте девятнадцати лет. Хотя Дилану не удалось реализовать все свои мечты ипотенциал, он вдохновил многих студентов продолжить свою миссию. Чтобы продолжить наследие Дилана, г-н Эспозито основал Клубгрид-вычислений Дилана Буччи, который знакомит новых студентов с WCG, какиспользовать платформу BOINC для поддержки научных открытий и обсуждает новыеразработки в исследовательских инициативах. У них есть значительное количествостудентов, в том числе Эрик Истер, который выступает в качестве студенческоголидера клуба и помогает управлять клубным оборудованием. Участие в проектах WCGнастолько велико, что студенты проявили интерес к еще одной поездке в Крембил,следуя по стопам Дилана. Г-н Эспозито сказал, что он был бы рад взять с собойновых студентов в эту поездку, чтобы они могли узнать больше и вдохновитьсявстречей с учеными, которые получают непосредственную пользу от их поддержкиWCG. Чтобы повысить интерес учащихся к платформамгрид-вычислений, Sisler организовал внутришкольные соревнования, чтобывыяснить, кто может пожертвовать наибольшую вычислительную мощность заограниченное время (по аналогии с мероприятием для студентов Стокгольмскойшколы науки и инноваций в Швеции, проведенным несколькими годами ранее). Команда SislerCyberAcademy также приняла участие вдвухнедельном конкурсе пожертвований MCM ComputefortheCure 2021. Даже будучиотносительно небольшой организацией, им удалось занять второе место, опередивкоманды из нескольких более крупных организаций. Студенты были очень увлеченысоревнованием и привлекли в свои команды многих других, таких как другиеучителя и их друзья по компьютерным играм. Г-н Эспозито сообщил, что этотсоревновательный порыв является чрезвычайно влиятельным мотиватором длястудентов и побуждает тех, кто опасается грид-вычислений, попробовать его. Скриншот окончательных результатов ComputefortheCure 2021,где команда SislerAcademy заняла второе место, несмотря на конкуренцию сомногими командами из более крупных организаций. Г-н Эспозито считает, что грид-вычисления могут быть чем-тобольшим, чем просто внеклассное занятие для учащихся. WCG также можно напрямуюинтегрировать в любую учебную программу по технологиям. Например, учителя могутиспользовать WCG в качестве всеобъемлющего технологического проекта в классе.Классный проект WCG будет включать в себя изучение компьютерного оборудования,программного обеспечения, сетей и кибербезопасности. Он также считает, что этоидеальный междисциплинарный проект, объединяющий как науку, так и технологии.Эрик, который использовал WCG в школе для соревнований и отдыха, сказал, чтополучил ценные технические знания, внося свой вклад в благое дело. Эрик решил создать специальную сеточную машину, котораяиспользует комбинацию мощностей центральной и графической обработки. В процессепроектирования и сборки было много проб и ошибок. Эрик провел утомительноеколичество часов, изучая и тестируя различные настройки для достиженияоптимальной стабильности при пиковых вычислительных мощностях. Эрик надеется привлечь больше школ к включениюгрид-вычислений в свои учебные программы, поскольку это принесет пользуглобальным исследовательским усилиям, а также учащимся, стремящимся внести свойвклад в исследования в области здоровья и устойчивого развития с помощью своихкомпьютеров, устройств Android или RaspberryPi. Эрик Истер, студенческий лидер вычислительного клубаДиланаБуччи, настраивает свой кластер GPU. Мы хотели бы поблагодарить г-на Эспозито и Эрика запредоставление материалов и изображений, использованных в этой статье. Если выхотите им помочь, они принимают пожертвования на новые компьютеры и видеокартычерез Фонд детского наследия в память о Дилане Буччи. Вы также можете связатьсяс ними через их веб-сайт. https://www.sislercyberacademy.org/ https://www.winnipegsd.ca/page/11974...-heritage-fund Мы стремимся предоставить захватывающую платформу длямотивации нового поколения. Если вы являетесь учителем или студентом, которыйзаинтересован, или если вы знаете тех, кто может быть, пожалуйста, свяжитесь снами напрямую. Команда WCG https://www.worldcommunitygrid.org/a...?articleId=601 https://boinc.berkeley.edu/ https://winnipeg.ctvnews.ca/techie-t...orts-1.5806410 https://www.sislercyberacademy.org/ Хотите принять участие враспределенных вычислениях, тогда, Вам сюда: https://boinc.berkeley.edu/wiki/Simple_view https://boinc.berkeley.edu/download_all.php https://boinc.ru Ссылка на git-хаб,где лежат исходники программы-клиента BOINC. https://github.com/BOINC/boinc   
|
|
21.05.2023, 21:37
|
#157 | ||||||
|
Re: Распределённые вычисления
Quote:
 Quote:
__________________
Quote:
1 пользователь оценил это сообщение: Показать
|
|
27.05.2023, 15:28
|
#158 | |||
|
Re: Распределённые вычисления
World Community Gridзавершил альфа-тестирование и перезапустится 13 апреля 2023 г.
Опубликовано: 13 апр 2023 г. Сеть мировогосообщества перезапущена! Уважаемые волонтеры, По состоянию на 13 апреля 2023 года World Community Gridзавершила альфа-тестирование и перезапустилась. Мы высоко ценим помощь итерпение сообщества в течение последних 14 месяцев. Мы рады расширить этумощную вычислительную платформу и дать большему количеству людей возможностьучаствовать в гражданской науке и увеличивать исследовательские прорывы спомощью масштабируемых, но устойчивых вычислений. С тех пор, как мы начали запускать WCG, мы столкнулись сомногими проблемами, и это заняло у нас значительно больше времени, чем мыожидали. Мы настоятельно рекомендуем волонтерам, которые решили приостановитьсвои взносы на этапе перезапуска, снова начать работать с нашей новой иулучшенной системой. Впечатляющий рост вычислительных мощностей WCG и участиедобровольцев за последние годы, естественно, замедлился за последний период, новместе мы можем гарантировать, что эта платформа будет расти и позволитвоплотить в жизнь, казалось бы, невозможные научные исследования. Это не означает, что наша серверная система идеальна или чтомы исправили все известные проблемы (см. наш полный список ошибок). Остальныепроблемы мы исправим со временем. Мы также работаем над расширениемдеятельности — и будем публиковать обновления в течение следующих несколькихнедель. https://www.worldcommunitygrid.org/f...d_thread,44246 Обновления проекта Большое спасибо добровольцам, альфа-тестерам WCG, которыепомогали нам находить ошибки и предоставляли научные данные на этапетестирования. После полного перезапуска несколько партнеров по исследованиямготовы к работе с новыми рабочими единицами на новом этапе исследований. Картирование маркероврака Добровольцы подсчитали 118 875 915 результатов для саркомына этапе альфа-тестирования. Тем временем мы продолжили анализидентифицированных 9 триллионов сигнатур генов рака легких. Наше вниманиесосредоточено на 26 генах, которые присутствуют в сигнатурах всех размеров. Изэтих 26 генов мы дополнительно исследовали VAMP1, ген, связанный со статусомкурения пациента, который был широко представлен у пациентов, переживших случаирака, что делает его хорошим выбором в качестве прогностического маркера. Дляполучения дополнительной информации ознакомьтесь с нашим недавним обновлениемисследования от команды MCM. OpenPandemics -COVID-19 На этапе альфа-тестирования добровольцы обработали 50 950437 результатов. OPN1 продолжает поиск новых методов лечения COVID-19 и создаетинструменты быстрого реагирования на будущие пандемии. Мы с нетерпением ждемвозможности поделиться с ними новыми новостями в ближайшее время. Помогите остановитьтуберкулез Команда анализировала предыдущие результаты и разрабатывалановые стратегии поиска. Кроме того, руководитель группы доктор Анна Крофтперейдет в Университет Лафборо в качестве профессора. Вместе с доктором Крофтоммы празднуем этот захватывающий шаг и верим, что WCG станет больше (идостаточно большим), когда станут доступны новые рабочие единицы HSTB. Разбить детский рак Команда SCC представила Никиту Розанова в качестве новогочлена команды, который использует свой опыт в компьютерном моделированиимолекул для разработки новых потенциальных лекарств для лечения рака. Команданачала исследование нового целевого белка FLI1. Он является членом семействафакторов транскрипции ETS, которые контролируют пролиферацию, дифференцировку ивыживание клеток. Слияние гена FL1 и EWSR1 часто присутствует в случаях саркомыЮинга и других видов рака. EWSR1 кодирует РНК-связывающий белок (EWS), и когда EWSсливается с FLI1, последний становится постоянно активируемым (вместо точнорегулируемого), создавая молекулярную среду для образования опухоли. Считалось,что слитый белок EWS-FLI1 ингибирует p53 и/или активирует передачу сигналовNOTCH, ускоряя прогрессирование саркомы. Полезные ингибиторы FLI1 должныспециально нацеливаться на этот слитый белок, но не на другие родственные,чтобы избежать непреднамеренных побочных эффектов. Для получения дополнительнойинформации ознакомьтесь с нашим недавним обновлением исследования от командыSCC. Вы имеете значение По любым вопросам о текущих проектах или процессеперезапуска прокомментируйте эту ветку форума или свяжитесь с нами напрямую. Мыобобщим наиболее частые вопросы в будущем обновлении часто задаваемых вопросов. Вместе мы можем сделать намного больше. WCG нуждается ввашей помощи! Если вы уже предоставляете свои вычислительные ресурсы, мыблагодарим вас; но если вы можете добавить больше устройств дома или в офисе,подумайте об этом, так как нам потребуется большая сетка для размещения новыхпроектов. Если вы еще не присоединились к World Community Grid, вы можетезарегистрироваться здесь. https://www.worldcommunitygrid.org/login https://www.worldcommunitygrid.org/f...d_thread,45232 https://www.worldcommunitygrid.org/a...?articleId=785 https://www.worldcommunitygrid.org/a...?articleId=782 Хотите принять участие в распределенных вычислениях, тогда,Вам сюда: https://boinc.berkeley.edu/wiki/Simple_view https://boinc.berkeley.edu/download_all.php https://boinc.ru Ссылка на git-хаб,где лежат исходники программы-клиента BOINC. https://github.com/BOINC/boinc  
|
|
04.06.2023, 07:36
|
#159 | |||
|
Re: Распределённые вычисления
Обновленная информация об исследовании от команды MCM(апрель 2023 г.)
Исследование биомаркеров рака легких, проведенноекомандой MCM, выявило 26 генов, которые присутствуют с высшими баллами по всемрассматриваемым размерам подписи. Это обновление фокусируется на потенциальномгене-биомаркере под названием FARP1, который связан с метастазированием ракалегких. Проект: Картирование маркеров рака Опубликовано: 28 апр 2023 Фон Проект «Картирование маркероврака» направлен на выявление маркеров, связанных с различными типами рака, сцелью выявления биомаркеров для раннего выявления рака, выявления пациентов свысоким риском и настройки лечения для отдельных пациентов. На сегодняшний деньволонтеры WCG по всему миру пожертвовали проекту более 818 200 процессоро-лет.Спасибо всем за вашу поддержку. Внашем предыдущее обновление проектаMCM,мы начали вводить предполагаемые биомаркеры рака легких, которые присутствуют свысшими баллами по всем рассматриваемым размерам подписи. Первое обновлениебыло сосредоточено на VAMP1, гене, связанном с выживаемостью пациента идифференциально экспрессируемом в нормальном легком по сравнению с ракомлегких. Это обновление подчеркивает потенциальный ген биомаркера под названиемFARP1, который связан с метастатическим развитием. Новыеразработки Белок,кодируемый FARP1, представляет собой фактор обмена гуаниновых нуклеотидов,который играет роль в образовании и росте дендритов. FARP1 может быть обнаруженв клеточных мембранах, цитоплазме, синапсах и дендритах (Юнипрот). Поскольку и VAMP1, и FARP1связаны с синапсами, мы исследовали, взаимодействуют ли эти два белка вместе. Покаони не взаимодействуют напрямую (ИУР; Integrated InteractionDatabase) у них есть два взаимодействующих партнера, РАБ6А и АПБА1. RAB6A играет роль в развитиипроекции нейронов, в то время как APBA1 регулирует APP (белок-предшественникамилоида болезни Альцгеймера) и, как полагают, играет роль в секрециисинаптических везикул. НиRAB6A, ни APBA1 не присутствуют в верхнем 99-м процентиле, но они предполагают,что действительно существует нейронный сигнал, связанный с двумя интересующиминас белками — VAMP1 и FARP1. Важность этого открытия связана с трудной дляизучения связью между раком легких и одним из наиболее частых местметастазирования: мозгом[1]. Более того, было показано, что FARP1является одним из ключевых факторов миграции и инвазии при раке легких[2]. Таким образом, мы решилипродолжить исследование важности этого гена, используя внешние наборы данных.FARP1 является потенциальным диагностическим биомаркером, похожим на VAMP1, какпоказано на рисунке 1. Кроме того, FARP1 дифференциально экспрессируется вметастатических образцах, усиливая связь между молекулярной функцией этогобелка и фенотипом, который он может помочь развить. Рисунок 1. Экспрессия FARP1 внормальных образцах, раке легких и метастатических образцах. Нашисигнатуры, полученные из набора данных пациентов с историей курения, могутпролить свет на молекулярные механизмы и поддержать исследователей, изучающихсвязь. Несмотря на то, что мыпродолжаем подтверждать наши результаты, мы воодушевлены тем, какое влияниенаши результаты могут оказать на жизнь пациентов и исследования, рассчитанныетысячами добровольцев. Благодарим вас за вклад в это исследование. Еслиу вас есть какие-либо комментарии или вопросы, пожалуйста, оставьте их в Этой ветке чтобы мы ответили.Спасибо за вашу поддержку, терпение и понимание. Команда WCG Ссылки: 1. СеМ., Су С. Микроокружение и прогресс иммунотерапии в клинической практикеметастазов НМРЛ в головной мозг. Передний онкол. 2023 Янв 24;12:1006284. DOI:10.3389/fonc.2022.1006284. PMID: 36761422; PMCID: PMC9902941. 2. КукМ., Крайдер-Леттерман Г., Бейкер М.Дж., Чжан С., Салливан Н.Т., Ерусланов Э.,Абба М.С., Гойкоэчеа С.М., Гарсия-Мата Р., Казаниец М.Г. FARP1, ARHGEF39 иTIAM2 являются важными эффекторами рецепторной тирозинкиназы для Rac1-зависимойподвижности клеток при аденокарциноме легкого человека. Cell Rep. 2021 2ноября;37(5):109905. DOI: 10.1016/J.celrep.2021.109905. PMID: 34731623; PMCID:PMC8627373. 3. ВучичЕ.А., Тху К.Л., Пикор Л.А., Энфилд К.С., Йи Дж., Инглиш Дж.С., Маколей С.Э.,Лам С., Юрисика И., Лам В.Л. Статус курения влияет на прогноз, опосредованныймикроРНК, и биологию аденокарциномы легкого. Рак BMC. 2014 Октябрь 24;14:778.DOI: 10.1186/1471-2407-14-778. PMID: 25342220; PMCID: PMC4216369. Хотите принять участие в распределенных вычислениях, тогда, Вамсюда: https://boinc.berkeley.edu/wiki/Simple_view https://boinc.berkeley.edu/download_all.php https://boinc.ru Ссылка на git-хаб, где лежат исходникипрограммы-клиента BOINC. https://github.com/BOINC/boinc 
|
|
11.06.2023, 08:33
|
#160 | |||
|
Re: Распределённые вычисления
Грег Боуман возглавляет международный суперкомпьютерный проект Folding@home.
Боумен возглавляет международный суперкомпьютерный проект Краудсорсинговая компьютерная сеть и исследует структуру белка и ищет новые методы лечения болезней. Грег Боуман, доктор философии, доцент кафедры биохимии и молекулярной биофизики Медицинской школы Вашингтонского университета в Сент-Луисе, возглавляет суперкомпьютерный проект под названием Folding@home. Проект направлен на разгадку тайн динамики белков, включая процесс сворачивания, и их роль в здоровье и болезни. Когда Грег Боуман представляет слайд-шоу о белках, которые он изучает, их трехмерные формы и узоры складывания воспроизводятся как анимация на большом экране. Когда он описывает эти молекулы, может быть легко упустить тот факт, что он не может видеть свою собственную презентацию, по крайней мере, не так, как это видят зрители. Боуман, официально признан слепым. Кроме того, сейчас он возглавляет один из крупнейших в мире проектов по вычислительной биологии, основанный на краудсорсинге. Усилия направлены на то, чтобы понять, как белки принимают правильную форму, и какие структурные движения они претерпевают, выполняя свою работу по поддержанию здоровья тела. Белки являются жизненно важными клеточными механизмами, и понимание того, как они собираются и функционируют — или неправильно функционируют — может пролить свет на многие из самых неприятных проблем в медицинской науке, от предотвращения болезни Альцгеймера до лечения рака и борьбы с устойчивостью к антибиотикам. Проект, получивший соответствующее название Folding@home, опирается на мощность десятков тысяч домашних компьютеров для выполнения сложных вычислений, необходимых для моделирования динамики белков, которые изучают Боумен и его коллеги. С такой сетевой вычислительной мощностью Folding@home, по сути, является одним из крупнейших в мире суперкомпьютеров. «Есть некоторые приверженцы традиционных суперкомпьютеров, которые могут не согласиться с такой характеристикой, — со смехом сказал Боуман. «Folding@home — это не одна массивная машина, а распределенная вычислительная сеть. Тысячи добровольцев по всему миру загружают наше программное обеспечение и вносят свой вклад в проект на своих домашних компьютерах. Но с точки зрения чистой вычислительной мощности — количества вычислений, которые он может выполнять в секунду — он находится на одном уровне с самыми большими суперкомпьютерами в мире». Боуман начал эту работу в лаборатории основателя Folding@home Виджая Панде, доктора философии, из Стэнфордского университета. Боумен получил докторскую степень в Стэнфорде и проводил там постдокторские исследования. После 18 лет у руля Панде выбрал Боумана, чтобы он возглавил компанию, благодаря чему Folding@home появился в следующем десятилетии и далее. Команда Боумена использует распределенную вычислительную сеть, чтобы сделать масштабные вычислительные задачи более управляемыми. Сложная проблема, которую невозможно решить на одной машине, может быть разбита на более мелкие части и распределена на 1000 компьютеров для одновременного решения. «У Грега уникальное сочетание навыков, — сказал Панде. «У него есть технические навыки, чтобы возглавить этот сложный проект, и у него есть навыки работы с людьми, чтобы управлять его распределенным характером, особенно учитывая тот факт, что в нем задействовано так много разных людей — как ученых, так и неученых. У Грега также есть прекрасное видение будущего этого проекта. Он не только будет следить за тем, чтобы задания шли вовремя, у него есть четкое представление о том, каким должен быть Folding@home через 10–20 лет». Огромные вычислительные мощности Folding@home имеют решающее значение для понимания сворачивания белков — проблемы, которую Боуман называет классической грандиозной задачей в биохимии и биофизике. Белки – это сырье, из которого состоит наш организм. Но они также являются молекулярными машинами, которые выполняют работу по созданию этих тел и обеспечивают их правильную работу. Чтобы выполнять свою работу, белок должен принять правильную форму. Если это не так, что-то пойдет не так. Боуман понимает это больше, чем большинство. Рожденный с нормальным зрением, Боумен постепенно терял зрение и к 9 годам официально стал слепым из-за наследственного заболевания, называемого болезнью Штаргардта. Форма ювенильной дегенерации желтого пятна возникает, когда белок, удаляющий отходы из клеток сетчатки, неправильно сворачивается и не может выполнять свою работу. В результате светочувствительные клетки сетчатки переполняются отходами и умирают, вызывая потерю центрального зрения. Команда Грега Боумена слушает презентацию на собрании своей лаборатории. Боуман сказал, что этот опыт пробудил страсть к биологии и стремление понять, что происходит, когда белки, на которые опирается наше тело, не работают должным образом. В конечном счете, он хотел бы найти способы исправить их. Но, будучи молодым студентом, Боумен быстро понял, что его путь в поле может выглядеть немного иначе, чем у обычного биолога. «Я узнал, что экспериментальная биология не очень доступна для людей с нарушениями зрения», — сказал Боуман. «По сути, я вижу в низком разрешении, в основном боковым зрением. Я могу ориентироваться в коридорах и лабораториях, но, например, я не могу читать по маленькому циферблату на пипетке. «Когда я понял это, я также влюбился в компьютеры», — сказал он. «Я увидел, что навыки информатики и математического моделирования можно применить к биологическим проблемам. Кроме того, одна из многих прелестей компьютеров заключается в том, что их действительно легко увеличивать. Я могу увеличивать изображение в 16 раз и прокручивать экран, чтобы читать научную статью или даже просто электронное письмо». С помощью Folding@home Боуман и его коллеги изучают белки и то, как они складываются более чем в 16 раз. Действительно, они приближаются настолько, насколько это физически возможно — вплоть до атомного уровня. С помощью этого объединенного в сеть суперкомпьютера ученые могут моделировать белки на уровне отдельных атомов за долю времени, которое потребовалось бы даже для мощных одиночных компьютеров. Многие важные биологические процессы, которые выполняют белки, происходят от миллисекунд до нескольких секунд. Это может показаться коротким, но для измерения атомов, когда они отскакивают друг от друга, требуется шкала времени в фемтосекундах — одна квадриллионная доля секунды. «Чтобы смоделировать свертывание всего за одну миллисекунду, даже для белка среднего размера, на первоклассном MacBook Pro потребуется около 500 лет», — сказал Боуман. «Но с помощью Folding@home мы можем разделить эти проблемы на множество независимых частей. Мы можем отправить их до 1000 человек одновременно. Выполняя эти расчеты параллельно, мы можем взять эти проблемы, на решение которых ушло бы 500 лет, и вместо этого решить их за шесть месяцев». На момент написания этой статьи у Folding@home было более 110 000 добровольных участников по всему миру, которые поделились частью своих домашних вычислительных мощностей. Судя по видеороликам некоторых волонтеров, их причины для участия в проекте, как и у Боумена, личные. Программа дает пользователям некоторый выбор в том, в какие проекты они вносят свой вклад, заинтересованы ли они, среди прочего, в расширении исследований рака, предотвращении болезни Альцгеймера или борьбе с устойчивостью к антибиотикам. Мэтью Круз, аспирант лаборатории Боумена, выступает с докладом на собрании лаборатории. Команда Боумена использует вычислительную мощность Folding@home для изучения того, как бактерии вырабатывают устойчивость к антибиотикам, и ищет способы борьбы с растущей угрозой лекарственно-устойчивых микробов. Боуман предвидит будущее, в котором Folding@home станет отправной точкой для разработки новых лекарств. Прямо сейчас ученым часто приходится изучать только одну хорошо известную белковую структуру. Например, бета-лактамаза — это белок, который некоторые бактерии используют для защиты от антибиотиков, таких как пенициллин. Белок имеет хорошо задокументированную, давно изученную структуру. Но эта структура представляет собой только один снимок бета-лактамазы в один момент времени. «Этот снимок содержит ценную информацию, — сказал Боуман. «Но это все равно, что увидеть фото строительной машины на стоянке и попытаться угадать, что она делает. На самом деле, вам бы хотелось понаблюдать за тем, как эта штука двигается, и увидеть, как она работает вместе с другими механизмами, чтобы, скажем, построить здание. Нам интересно наблюдать за тем, как движется каждый атом в белке — когда он впервые собирается и выполняет свою работу. Атомы в белке никогда не стоят на месте, они постоянно толкаются и перемещаются. И одна генетическая мутация изменяет, может быть, дюжину атомов из тысячи. Мы хотим понять, что это делает со всем белком». Среди нескольких проектов собственная лаборатория Боумена использует Folding@home для поиска новых лекарств для борьбы с устойчивостью к антибиотикам. Наблюдение за движением бета-лактамазы, например, уже выявило то, что Боумен называет «скрытыми карманами» — слабыми местами в белке, на которые могут воздействовать лекарства, но которые не видны на давно изученном снимке этого белка. Скрытые карманы обнаруживаются только тогда, когда белок движется. Поскольку Боумен видит мир немного иначе, чем большинство людей, Folding@home предлагает ученым другой взгляд на давно изучаемые белки, раскрывая решения биологических проблем, которые в противном случае могли бы остаться скрытыми от глаз. Чтобы заставить свой компьютер складывать белки, посетите веб-сайт Folding@home. Боумен и сотрудники его лаборатории используют компьютеры для моделирования динамики белков, исследования, которые имеют значение для понимания и, возможно, лечения многих типов заболеваний. Исследователи приглашают гражданских ученых присоединиться к их усилиям, добровольно поделившись частью вычислительных мощностей своих домашних компьютеров. Посетите foldathome.org для получения дополнительной информации. https://foldingathome.org/start-folding/ https://biochem.wustl.edu/faculty/bowman https://medicine.wustl.edu/news/bowm...uting-project/ Хотите принять участие в распределенных вычислениях, тогда, Вам сюда: https://boinc.berkeley.edu/wiki/Simple_view https://boinc.berkeley.edu/download_all.php https://boinc.ru Ссылка на git-хаб, где лежат исходники программы-клиента BOINC. https://github.com/BOINC/boinc   
|
|
21.06.2023, 17:13
|
#162 | |||
|
Re: Распределённые вычисления
Рабочиеединицы SCC для целей FLI-1 и MyoD1
Новые рабочие единицы SCC сосредоточены на новых мишенях дляEWS-FLI-1. Проект: Разбить детский рак Опубликовано: 21 апр 2023 г. Фон Проект Smash Childhood Cancer направлен на поиск лучшихлекарств, нацеленных на ключевые молекулы рака у детей. Этому исследованиюпомогли тысячи членов World Community Grid по всему миру, которые пожертвовалиэтому проекту более 48 тысяч процессоро-лет. Благодаря их помощи команда смогларазработать лекарства от нескольких типов рака, таких как нейробластома (ракнервных тканей), гепатобластома (рак печени), остеосаркома (рак костей) и,совсем недавно, саркома Юинга. Невероятный темп. Обновление рабочейединицы SCC Команда SCC начала исследование новой мишени под названиемFLI-1, гена, который контролирует пролиферацию, дифференцировку и выживаниеклеток. При слиянии с EWSR1 комбинированный белок EWS-FLI-1 является важнымфактором роста клеток саркомы Юинга. Создание контрмер против FLI1 в виде ингибиторов можетпривести к излечению саркомы Юинга в будущем. Для получения дополнительнойинформации прочитайте нашу предыдущую статью об обновлении SCC. Мы рады сообщить, что с сегодняшнего дня мы смогли сделатьновые рабочие единицы SCC доступными для волонтеров. Команда SCC поделилась снами этим заявлением о характере этих рабочих единиц: В Детском институте развития терапии рака мы очень радыработать с доктором Тюдзи Хосино из Университета Тиба в рамках международногосотрудничества World Community Grid. Наш существующийпроект, который уже был рассчитан: 1. ингибитор белка PAX-FOXO1, вовлеченного в иногдасмертельный рак мышц у детей, рабдомиосаркому. Результаты этого проекта изапланированные последующие исследования недавно были рассмотрены NIH иполучили очень положительную оценку гранта. 2. ингибитор фактора транскрипции CREB при ракеподростков и молодых взрослых, светлоклеточной саркоме. Наша связанная с этимработа с нашими коллегами из Atomwise была недавно опубликована в BritishJournalofCancer.Работа WCG расширяет эту программу открытия лекарств. 3. ингибитор остеопонтина, прометастазирующегофактора многих видов рака у детей и взрослых. 4. ингибитор белка TrkB детского рака нервнойсистемы, нейробластомы. Новые рабочиеединицы: 1. связывающие соединения для белка FLI1,обнаруженные в раковых опухолях саркомы Юинга, 2. связывающие соединения для мутантного белкаMyoD1, обнаруживаемого при неблагоприятном прогнозе склерозирующего рака ирабдомиосаркомы из веретенообразных клеток, и связывающие соединения для белка KLF15, обнаруженные внеизлечимой детской и взрослой раковой миоэпителиальной карциноме. Предварительныйпросмотр изображения Спасибо команде SCC за то, что поделились этим с нами. Мы снетерпением ждем возможности поделиться с ними новыми научными новостями помере продвижения исследований. Если у вас есть какие-либо комментарии иливопросы, пожалуйста, оставьте их в этой теме, чтобы мы ответили. Команда WCG Хотите принять участие в распределенных вычислениях, тогда,Вам сюда: https://boinc.berkeley.edu/wiki/Simple_view https://boinc.berkeley.edu/download_all.php https://boinc.ru Ссылка на git-хаб,где лежат исходники программы-клиента BOINC. https://github.com/BOINC/boinc |
|
21.06.2023, 18:29
|
#163 | ||||
|
Re: Распределённые вычисления
Quote:
__________________
«Оленя надо забанить пока не стало слишком поздно» (с) 02nz «Как же хорошо без оленя, боже мой» (с) R3DTHR3AT  |
|
21.06.2023, 18:57
|
#164 | ||||
|
Re: Распределённые вычисления
зачем майнить и по 100 раз считать какую-то уйню, которую придумали под сильным передозом норкотических веществ?
это не дает понимания бытия. а без понимания бытия можно вычислить сколько лапок нужно оторвать таракану, чтобы получить новые виды
 вся сутьда и существование интернетов доказало, что 10 мильярдов обезьян производящие распределенные вычисления не напишут роман Война и мир
__________________
Quote:
|
|
08.09.2023, 18:26
|
#165 | |||
|
Re: Распределённые вычисления
Доступна новая версия BOINC (7.24.1).
Описание последней версии Изменения в версии 7.24.1 Улучшена реализация регулировкипроцессора значение по умолчанию для настройки «suspend_if_no_recent_input»равно 0, а не 60 если запланированный запрос не удался, укажите URL-адреспланировщика (это может быть проблемой). Показывать предупреждение, если времяпростоя для возобновления вычислений превышает время простоя для приостановкивычислений. Игнорировать старые настройки,отправленные проектами или AM избегайте перепланирования процессоров приналичии заданий MT Диспетчер: ошибка в диалоговом окневычислений настроек Менеджер: добавьте кнопку в журналсобытий, чтобы отображать только оповещения (ошибки). Менеджер: улучшение согласованностиконтрольных меток и ускорителей. Менеджер: показывать родные названиядля языковых вариантов и только тех, для которых доступны переводы. Android: в случае приостановки из-заперегрева или зарядки аккумулятора не возобновляйте работу в течение какминимум 5 минут. Mac: поддержка темного режима врасширенном просмотре Mac: добавлен стандартный ярлыккоманды-запятой для пункта меню «Настройки». (Release notes for the BOINC Client: Changes in 7.24.1 § improve implementation ofCPU throttling § the default value for the"suspend_if_no_recent_input" pref is 0, not 60 § if sched request fails,show the scheduler URL (that might be the problem) § Show alert if idle time toresume computing is greater than idle time to suspend computing § ignore old prefs sent byprojects or AM § avoid overscheduling CPUsin presence of MT jobs § Manager: computing prefsdialog bug § Manager: Add button inevent log to display only alerts (errors) § Manager: Improveconsistency of control labels and accelerators § Manager: Show native namesfor language options, and only those for which translations are available § Android: if suspendbecause of battery heat or charge, don't resume for at least 5 minutes. § Mac: Support Dark Mode inAdvanced View § Mac: Add standardcommand-comma shortcut for Preferences menu item) 
|
|
17.09.2023, 06:07
|
#167 | |||
|
Re: Распределённые вычисления
Новые приложения OpenCL для графических процессоров AMD в проекте Asteroids@home!
https://asteroidsathome.net/boinc/fo...ead.php?id=967 Всем привет, Мы с гордостью представляем наши новые приложения OpenCL для графических процессоров AMD! Процесс разработки занял некоторое время, но нам наконец удалось его построить. Нам еще предстоит доработать много недоработок, но благодаря вам, ребята, и вашим отзывам мы продолжим улучшать код. Для приложения Linux требуется 64-битная ОС с GLIBC v2.31 или выше, и оно будет работать на большинстве графических карт AMD Radeon и некоторых интегрированных графических процессорах AMD с поддержкой OpenCL 1.1 или выше. Для приложения Windows требуется 64-битная версия Windows 10 или 11, и оно будет работать на большинстве карт AMD Radeon и некоторых интегрированных графических процессорах AMD с поддержкой OpenCL 1.2 или выше. Приятного счета и спасибо за вашу поддержку! Команда Asteroids@home. Array 
|
|
08.10.2023, 04:39
|
#168 | |||
|
Re: Распределённые вычисления
«Естькто-нибудь здесь?»
Астрономы ждут ответа от Альтаира Автор: КАЗУКИ ЭНДО/штатный автор https://www.asahi.com/ajw/articles/photo/47013614 НАГАНО – Астрономы с нетерпением ждут первого контакта разумнойжизни с посланием, переданным в космос 40 лет назад. Они надеются, что ответ с Альтаира, находящегося в 16,7 световыхгодах от Земли, вполне может прийти уже сейчас, учитывая относительную близостьзвездной системы и прошедшее время. Символично, что наблюдатели за звездами решили, что 22 августа,когда 7 июля звездный фестиваль Танабата с участием небесных «любовников»Альтаира и Веги выпадает на лунный календарь, самое подходящее время для ожиданиясообщения «оттуда». ». Команда под руководством Синья Нарусавы из Университета Хёгоразвернёт антенну диаметром 64 метра в Саку, префектура Нагано, в надежденаблюдать радиосигналы в ответ на сообщение, отправленное в 1983 году. Послание, состоящее из 13 рисунков, изображающих историю жизни наЗемле, внешний вид людей и другую информацию, было создано астрономами МасакиМоримото и Хисаси Хирабаяси. По словам Нарусавы, радиосигналы, изображающие эти рисунки, былипереданы из Соединенных Штатов 15 августа 1983 года в рамках проектакосмической тематики, посвященного 15-летию еженедельной антологии комиксовShonen Jump. Моримото, японский пионер в области, известной как поисквнеземного разума (SETI), работал в Токийской астрономической обсерваторииТокийского университета, которая сейчас является частью Национальнойастрономической обсерватории Японии. Сейчас он умер. Хирабаяси — почетный профессор Японского агентства аэрокосмическихисследований. 58-летний Нарусава сказал, что где-то во Вселенной должнасуществовать разумная жизнь за пределами Земли. «С 1990-х годов было обнаружено большое количество экзопланет», —сказал Нарусава, который также является исследователем SETI. «У Альтаира может быть планета, окружающая среда которой можетподдерживать жизнь». Его команда будет тренировать антенну в Центре глубокого космосаУсуда JAXA в течение одного часа с 22:00. 22 августа. В Танабате японцы молятся о том, чтобы пастух и ткач, любовники,разделенные в мифологии Млечным Путем, могли встретиться хотя бы раз в году, 7июля. Пастух представлен Альтаиром в созвездии Орла, а ткачотождествляется с Вега в созвездии Лиры. В этом году Танабата выпадает на 22 августа по лунному календарю.В 1983 году, когда вопрос «Привет, есть кто-нибудь?» Послание было передано нанебеса, оно вернется 15 августа. Хотите принять участие в распределенных вычислениях, тогда, Вамсюда: https://boinc.berkeley.edu/wiki/Simple_view https://boinc.berkeley.edu/download_all.php https://boinc.ru Ссылка на git-хаб, где лежат исходники программы-клиента BOINC. https://github.com/BOINC/boinc 
|
|
02.11.2023, 19:08
|
#169 | |||
|
Re: Распределённые вычисления
Космический телескопGaia и исследование длиннопериодических комет
Расчет долгопериодических орбит комет при одновременныхгалактических и звездных возмущениях. (Задача N тел с N порядка 400). http://150.254.66.104/gaiaathome/img/aa38451-20.pdf Изменения орбиты C/2002 T7, проецируемые на его исходнуюорбитальную плоскость, описанную пятью снимками в каталоге CODE. Красная линияпоказывает движение этой кометы в прошлом, а синяя линия — ее будущую эволюцию.Выделены пять эпох (снимков), когда регистрируются элементы орбиты: 1 - соприкасающаяся гелиоцентрическая орбита вблизи центраинтервала наблюдений (обычно вблизи перигелия); 2 - зафиксированная в прошлом исходная барицентрическаяорбита на расстоянии 250 а.е. от Солнца; 3 - будущая барицентрическая орбита, зафиксированная вбудущем на расстоянии 250 а.е. от Солнца; 4 – предыдущая орбита, зафиксированная в предыдущемперигелии; 5 - следующая орбита, в данном случае зафиксированная награнице ухода на расстоянии 120 000 а.е. от Солнца, но для многих других кометзафиксированная в следующем перигелии. Динамическая эволюция номинальной орбиты C/2002 T7 LINEAR(решение d6) при одновременных галактических и звездных возмущениях. Леваявертикальная ось описывает график гелиоцентрического расстояния (тонкие синиелинии) и расстояния до перигелия (зеленые линии, которые становятся черными,если e превышает 1,0). Правая вертикальная ось описывает угловые элементы(относительно плоскости диска Галактики): наклонение (линия цвета фуксии) иаргумент перигелия (красная линия). Тонкие линии описывают динамику, когда всезвездные возмущения опущены. Звездные приближения http://150.254.66.104/gaiaathome/img/aa29835-16.pdf Целью данной работы является исследование параметровблизости и влияния тесного сближения звезд на основе Gaia DR2 и DR3. С помощьючисленного интегрирования в осесимметричной модели Галактики определены новыепараметры тесного сближения звезд. Добавляя десять тысяч клонов, нарисованных с помощьюковариационной матрицы, мы оцениваем наиболее вероятное положение и скоростьзвезд на минимальном расстоянии от Солнца. подробнее: Берски Ф. и Дыбчински П.А., 2020: Параметрыблизкого сближения пересчитаны на основе первого выпуска данных Gaia. Облако из 13517 клонов звезды Глизе 710, построенное поковариационной матрице, взятой из каталога Gaia DR2. Это облако проецируется на максимальную плоскость рассеянияX'Y', координаты выражены в парсеках. Красная точка — это положение Солнца,зеленая точка — номинальное положение звезды во время встречи, а оранжевыйкрест — центроид облака клонов. Синий пунктирный круг показывает приблизительнуюпротяженность кометного облака Оорта. Параметры этой звезды известны с хорошейточностью, поэтому облако клонов довольно компактно. Облако из 11327 клонов звезды ALS 9243, построенное поковариационной матрице, взятой из каталога Gaia DR2. Это облако проецируется на максимальную плоскость рассеянияX'Y', координаты выражены в парсеках. Красная точка — это положение Солнца,зеленая точка — номинальное положение звезды во время встречи, а оранжевыйкрест — центроид облака клонов. Синий пунктирный круг показываетприблизительную протяженность кометного облака Оорта. Параметры этой звездыимеют низкую точность, но звезду необходимо детально изучить, поскольку онаможет иметь большую массу, даже более 10 масс Солнца. Gliese 710 пройдет мимоСолнца еще ближе. Хотите принять участие в распределенных вычислениях, тогда,Вам сюда: https://boinc.berkeley.edu/wiki/Simple_view https://boinc.berkeley.edu/download_all.php https://boinc.ru Ссылка на git-хаб, где лежат исходники программы-клиентаBOINC. https://github.com/BOINC/boinc http://150.254.66.104/gaiaathome/about.php    
|
не закралась ли в них ошибка? 
|
11.11.2023, 00:31
|
#171 | |||||
|
Re: Распределённые вычисления
Quote:
в анус себе вычисления пусть засунут. будет и вид и перфоманс ™  забавно то, что этот бот живет на форуме и всем норм  вычисления ради вычислений
__________________
Quote:
|
|
10.12.2023, 12:05
|
#172 | ||||
|
Re: Распределённые вычисления
Quote:
|
|
10.12.2023, 12:13
|
#173 | |||||
|
Re: Распределённые вычисления
Quote:
то что можно вычислить - вычисляется с конечным результатом без каких-то там сферических схождений звезд в вакууме, которые будут считаться чем-то верным потому что бабка так скажет такие вычисляют 10 лет, вычисляют, а потом так - хоба -  а за 5 сек нельзя было посчитать?
__________________
Quote:
|
|
11.12.2023, 09:00
|
#174 | |||
|
Re: Распределённые вычисления
Мы с гордостью сообщаем о нашем новом набореоптимизированных приложений, которые будут использовать механизмы с поддержкойнабора инструкций AVX512 или, точнее, те, которые поддерживают инструкцииAVX512dq!
Эти приложения созданы для поддержки ОС Linux и Windows с64-битной архитектурой. Разработка этой версии стала возможной благодаряогромной помощи команды Ахорека! https://asteroidsathome.net/boinc/sh...hp?userid=3496 К сожалению, оказывается, что клиентские приложения BOINCдля Windows по-прежнему не сообщают серверу все параметры процессора правильно.Это из-за известной ошибки, и даже после множества обсуждений на каналах BOINCона все еще существует. Хорошей новостью является то, что благодаря командеАхорека исправление уже было принято и добавлено в репозиторий BOINC, иисправление будет применено после выпуска версии клиента 7.26.0. А до этогомомента, чтобы запустить приложение AVX512, вам может потребоватьсяпереключиться на анонимную платформу. Мы хотели бы напомнить вам, что хотя сервер Boinc способеннайти наиболее эффективное приложение для каждой конкретной системы с учетоммножества факторов, через некоторое время он начнет отправлять подходящееприложение для каждой конкретной системы. Это означает, что даже если вашпроцессор поддерживает инструкции AVX512dq, он все равно может получать задачиFMA или AVX, и вам не о чем беспокоиться. В таком случае вы можете попробоватьтак называемую анонимную платформу, где ваш клиент будет явно запрашиватьприложение AVX512. https://asteroidsathome.net/boinc/fo...ead.php?id=988 Приятного счета и спасибо за вашу поддержку! Команда Asteroids@home |
|
11.12.2023, 09:06
|
#175 | ||||
|
Re: Распределённые вычисления
Мы с гордостью сообщаем о нашем новом расхомяцкооптимизированных приложений для добровольного майнинга крипты в пользу хозяина ботофермы
__________________
Quote:
|
